Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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