Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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