Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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TNXAQ16473 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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TNXAQ16473 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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