Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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