Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms