Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SS18Q15532 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18Q15532 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SS18Q15532 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18Q15532 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18Q15532 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SS18Q15532 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SS18Q15532 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SS18Q15532 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SS18Q15532 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SS18Q15532 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SS18Q15532 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SS18Q15532 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SS18Q15532 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SS18Q15532 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SS18Q15532 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SS18Q15532 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SS18Q15532 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SS18Q15532 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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