Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
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SIX1Q15475 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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