Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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SYCP1Q15431 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
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SYCP1Q15431 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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SYCP1Q15431 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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SYCP1Q15431 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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