Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
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