Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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