Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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