Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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EBI3Q14213 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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EBI3Q14213 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBI3Q14213 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EBI3Q14213 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EBI3Q14213 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBI3Q14213 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EBI3Q14213 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EBI3Q14213 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBI3Q14213 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBI3Q14213 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBI3Q14213 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBI3Q14213 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EBI3Q14213 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EBI3Q14213 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EBI3Q14213 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EBI3Q14213 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EBI3Q14213 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
EBI3Q14213 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBI3Q14213 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EBI3Q14213 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EBI3Q14213 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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