Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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