Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
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