Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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