Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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CDH18Q13634 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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