Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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MKRN4PQ13434 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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MKRN4PQ13434 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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MKRN4PQ13434 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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MKRN4PQ13434 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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MKRN4PQ13434 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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MKRN4PQ13434 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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