Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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