Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms