Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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IFT88Q13099 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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IFT88Q13099 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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IFT88Q13099 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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IFT88Q13099 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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