Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms