Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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