Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms