Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms