Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
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