Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms