Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms