Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms