Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB3Q04118 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms