Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms