Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AL359641.1-201ENST00000412509 1558 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AC096759.2-202ENST00000515230 777 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 DYNLT1-203ENST00000367089 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 PPIL3-202ENST00000392283 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AC004918.1-201ENST00000467537 770 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AP005597.1-201ENST00000534192 802 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms