Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms