Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A3Q01959 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms