Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms