Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTBP60709 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTBP60709 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTBP60709 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTBP60709 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTBP60709 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTBP60709 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTBP60709 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTBP60709 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms