Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms