Protein–RNA interactions for Protein: P56470

LGALS4, Galectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS4P56470 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGALS4P56470 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms