Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP9P55211 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CASP9P55211 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP9P55211 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP9P55211 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms