Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP7P55210 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP7P55210 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP7P55210 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP7P55210 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP7P55210 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP7P55210 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP7P55210 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP7P55210 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP7P55210 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP7P55210 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP7P55210 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP7P55210 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP7P55210 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP7P55210 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP7P55210 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP7P55210 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP7P55210 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP7P55210 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP7P55210 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP7P55210 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP7P55210 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP7P55210 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP7P55210 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP7P55210 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP7P55210 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP7P55210 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP7P55210 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP7P55210 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP7P55210 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP7P55210 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP7P55210 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP7P55210 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP7P55210 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP7P55210 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP7P55210 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP7P55210 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP7P55210 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP7P55210 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP7P55210 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP7P55210 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP7P55210 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP7P55210 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP7P55210 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP7P55210 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP7P55210 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP7P55210 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP7P55210 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP7P55210 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP7P55210 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP7P55210 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP7P55210 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP7P55210 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP7P55210 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP7P55210 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP7P55210 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP7P55210 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP7P55210 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP7P55210 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP7P55210 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP7P55210 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP7P55210 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP7P55210 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP7P55210 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP7P55210 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP7P55210 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP7P55210 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP7P55210 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP7P55210 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP7P55210 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP7P55210 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP7P55210 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP7P55210 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP7P55210 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP7P55210 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP7P55210 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP7P55210 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP7P55210 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP7P55210 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP7P55210 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP7P55210 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP7P55210 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP7P55210 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP7P55210 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP7P55210 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP7P55210 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP7P55210 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP7P55210 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP7P55210 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP7P55210 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP7P55210 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP7P55210 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP7P55210 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP7P55210 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP7P55210 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP7P55210 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP7P55210 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP7P55210 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP7P55210 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP7P55210 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms