Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMP3P54852 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMP3P54852 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMP3P54852 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMP3P54852 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMP3P54852 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMP3P54852 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMP3P54852 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMP3P54852 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EMP3P54852 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMP3P54852 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMP3P54852 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMP3P54852 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMP3P54852 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMP3P54852 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMP3P54852 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMP3P54852 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMP3P54852 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMP3P54852 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMP3P54852 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMP3P54852 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMP3P54852 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMP3P54852 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMP3P54852 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMP3P54852 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMP3P54852 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMP3P54852 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMP3P54852 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMP3P54852 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMP3P54852 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMP3P54852 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMP3P54852 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMP3P54852 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMP3P54852 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EMP3P54852 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMP3P54852 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMP3P54852 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMP3P54852 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMP3P54852 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMP3P54852 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMP3P54852 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMP3P54852 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMP3P54852 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMP3P54852 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMP3P54852 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMP3P54852 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EMP3P54852 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMP3P54852 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMP3P54852 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMP3P54852 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMP3P54852 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMP3P54852 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms