Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NDST1P52848 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDST1P52848 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDST1P52848 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDST1P52848 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDST1P52848 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDST1P52848 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDST1P52848 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDST1P52848 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDST1P52848 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDST1P52848 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDST1P52848 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDST1P52848 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NDST1P52848 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDST1P52848 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDST1P52848 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDST1P52848 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDST1P52848 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDST1P52848 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDST1P52848 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDST1P52848 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDST1P52848 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDST1P52848 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDST1P52848 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDST1P52848 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDST1P52848 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDST1P52848 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDST1P52848 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDST1P52848 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDST1P52848 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDST1P52848 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDST1P52848 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDST1P52848 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDST1P52848 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDST1P52848 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDST1P52848 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NDST1P52848 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NDST1P52848 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NDST1P52848 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDST1P52848 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDST1P52848 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDST1P52848 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDST1P52848 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDST1P52848 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms