Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA2P51531 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA2P51531 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA2P51531 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA2P51531 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA2P51531 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA2P51531 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SMARCA2P51531 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SMARCA2P51531 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SMARCA2P51531 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SMARCA2P51531 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SMARCA2P51531 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SMARCA2P51531 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SMARCA2P51531 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA2P51531 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA2P51531 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA2P51531 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA2P51531 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA2P51531 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA2P51531 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA2P51531 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA2P51531 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA2P51531 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA2P51531 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA2P51531 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA2P51531 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA2P51531 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA2P51531 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA2P51531 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCA2P51531 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA2P51531 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA2P51531 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA2P51531 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA2P51531 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA2P51531 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA2P51531 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA2P51531 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA2P51531 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA2P51531 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA2P51531 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA2P51531 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA2P51531 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCA2P51531 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
SMARCA2P51531 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms