Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms