Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms