Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTRNP46939 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTRNP46939 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTRNP46939 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTRNP46939 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UTRNP46939 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTRNP46939 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTRNP46939 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTRNP46939 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTRNP46939 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTRNP46939 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTRNP46939 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTRNP46939 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTRNP46939 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTRNP46939 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTRNP46939 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UTRNP46939 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UTRNP46939 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UTRNP46939 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UTRNP46939 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UTRNP46939 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UTRNP46939 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UTRNP46939 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UTRNP46939 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UTRNP46939 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UTRNP46939 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UTRNP46939 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UTRNP46939 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UTRNP46939 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UTRNP46939 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UTRNP46939 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UTRNP46939 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UTRNP46939 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UTRNP46939 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UTRNP46939 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UTRNP46939 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UTRNP46939 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UTRNP46939 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UTRNP46939 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UTRNP46939 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UTRNP46939 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UTRNP46939 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UTRNP46939 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UTRNP46939 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UTRNP46939 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UTRNP46939 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UTRNP46939 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UTRNP46939 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
UTRNP46939 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
UTRNP46939 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTRNP46939 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTRNP46939 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTRNP46939 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTRNP46939 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTRNP46939 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTRNP46939 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTRNP46939 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTRNP46939 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTRNP46939 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTRNP46939 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTRNP46939 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTRNP46939 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTRNP46939 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTRNP46939 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTRNP46939 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTRNP46939 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTRNP46939 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTRNP46939 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTRNP46939 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTRNP46939 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTRNP46939 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTRNP46939 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTRNP46939 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTRNP46939 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTRNP46939 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTRNP46939 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTRNP46939 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTRNP46939 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTRNP46939 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTRNP46939 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTRNP46939 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTRNP46939 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UTRNP46939 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTRNP46939 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTRNP46939 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UTRNP46939 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTRNP46939 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UTRNP46939 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTRNP46939 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTRNP46939 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTRNP46939 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTRNP46939 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTRNP46939 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTRNP46939 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTRNP46939 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTRNP46939 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UTRNP46939 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTRNP46939 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTRNP46939 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTRNP46939 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms