Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms