Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms