Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms