Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms