Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms